学校1986年成为全国第三批硕士学位授予单位， 2012年获批服务国家特殊需求博士人才培养项目单位，2017年获批山东省博士学位授予立项建设单位，2019年“健康中国背景下重大健康风险预测与治理策略”研究项目获批招收博士后研究人员资格。

学校主动对接经济社会发展需求，全面优化学科布局，逐步建成了以医学为主体，医学及相关学科协调发展的学科专业布局。中医药信息学获批国家高水平中医药重点学科；临床医学学科位列ESI全球前5‰，获批“山东省一流学科”；公共卫生与预防医学学科为“山东省一流学科”培育建设学科，获批省属高校“高水平学科”；药理学与毒理学学科位列ESI全球前1%。现有服务国家特殊需求博士人才培养项目1个；基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、生物学、护理学、中西医结合、口腔医学、心理学、公共管理学、医学技术等硕士学位授权一级学科11个，应用心理、生物与医药、临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学、公共管理等硕士专业学位授权类别8个。学位点主要分布在医学、理学、工学、管理学、教育学五个学科门类。

学位与研究生教育坚持“服务需求、提高质量”这条主线，主动作为，真抓实干，持续增进学科发展内涵，不断推进研究生培养模式改革，加强导师队伍建设，完善学位论文质量保障体系，强化学位点支撑条件建设，不断推进研究生教育治理体系和治理能力现代化，全面提升研究生教育综合实力。教育部博士学位论文抽检中连续4年全部合格，省级硕士学位论文抽检中连续9年全部合格，研究生人才培养成果获国家级教学成果二等奖、省级教学成果特等奖等省部级及以上教学成果奖励18项。